El doctor Janez Potočnik nació en 1958. Se graduó con honores en la Facultad de Economía de la Universidad de Ljubljana. Durante varios años (1989-1993) trabajó como investigador en el Instituto de Investigación Económica de Ljubljana. En julio de 1994 fue nombrado Director del Instituto de Análisis Macroeconómico y Desarrollo de la República de Eslovenia. En abril de 1998, el Gobierno de la República de Eslovenia nombró al Dr. Potočnik Jefe del Equipo de Negociación para la Adhesión de la República de Eslovenia a la Unión Europea. De junio a diciembre de 2000 fue también director interino de la Oficina del Gobierno para Asuntos Europeos. En junio de 2001 fue nombrado Ministro Consejero de la Oficina del Primer Ministro. El 24 de enero de 2002, el Gobierno de la República de Eslovenia lo nombró Ministro sin cartera, responsable de Asuntos Europeos.
De 1991 a 2004 el Dr. Potočnik ejerció de profesor auxiliar en la Facultad de Derecho de la Universidad de Ljubljana, donde impartió clases de estadística y economía. El doctor Potočnik fue nombrado miembro de la Comisión Europea el 1 de mayo de 2004. De 2004 a 2010 fue responsable de Ciencia e Investigación. En 2010 asumió un segundo mandato como Miembro de la Comisión Europea responsable del Medio Ambiente. El mandato terminó el 1 de noviembre de 2014.
En 2014 fue nombrado, por un período de tres años, miembro y copresidente del Panel de Recursos Internacionales, auspiciado por el Programa de las Naciones Unidas para el Medio Ambiente. Ese mismo mes, fue nombrado asimismo Presidente del Foro para el Futuro de la Agricultura y miembro del Consejo Asesor del Centro de Política Europea.
En mayo de 2008, el Imperial College de Londres le concedió el título honorífico de Doctor en Ciencias. En marzo de 2009 recibió un título honorífico de la Universidad de Gante (Bélgica). En septiembre de 2013 recibió el Premio Champions of the Earth de las Naciones Unidas.